Chercheur.euse en épidémiologie spatiale

Vos missions en quelques mots

En vous appuyant sur des projets financés en cours, des bases de données spatialisées disponibles et des collaborations établies avec les acteur.trice.s de la gestion des risques sanitaires, votre mission consistera à développer de nouvelles approches en épidémiologie spatiale afin d’améliorer la surveillance des maladies infectieuses animales. Ces travaux viseront en particulier à renforcer la capacité des dispositifs de surveillance à détecter précocement de nouvelles émergences, et à identifier les populations au sein desquelles la surveillance doit être priorisée, notamment lors d’épidémies. Ce poste aura également vocation à vous permettre d’affirmer votre capacité à définir, construire et porter une ligne de recherche propre en épidémiologie spatiale.

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Vous serez en charge de : développer des cadres méthodologiques innovants permettant, d’une part, d’intégrer les dimensions spatiales et les réseaux de contacts et, d’autre part, de combiner des sources de données hétérogènes au sein de modèles représentant explicitement les processus épidémiologiques et d’observation. Pour cela, vous mobiliserez des méthodes d’inférence bayésienne ainsi que des développements récents en intelligence artificielle ; développer des pipelines d’analyse reproductibles et régulièrement actualisables, permettant l’intégration de nouvelles données et la production d’indicateurs spatiaux en temps quasi réel, afin d’appuyer la priorisation de la surveillance ; appliquer et évaluer ces approches sur plusieurs cas d’étude, qui pourront notamment porter sur la surveillance syndromique fondée sur les données de mortalité en élevage et dans la faune sauvage, la surveillance de l’influenza aviaire hautement pathogène chez les oiseaux sauvages et l’étude de la transmission de la tuberculose bovine en France. D’autres pathosystèmes pourront être mobilisés en fonction des opportunités scientifiques et des besoins des partenaires porteurs d’enjeux liés à la surveillance sanitaire ; construire et porter un programme de recherche en épidémiologie spatiale, en développant des collaborations au sein de l’Unité et avec ses partenaires nationaux et internationaux, en valorisant les résultats par des publications scientifiques, des logiciels et des méthodes réutilisables, et en contribuant au montage de nouveaux projets et à la recherche de financements. L’objectif étant de consolider durablement cet axe méthodologique au sein du collectif de recherche.

Ces activités seront conduites en collaboration étroite avec des épidémiologistes, modélisateur.trice.s, écologues, informaticien.ne.s et acteur.trice.s des dispositifs de surveillance en santé animale. Vous bénéficierez d’une autonomie scientifique importante pour définir vos orientations méthodologiques, développer un programme de recherche et établir de nouvelles collaborations, en cohérence avec les priorités scientifiques de l’unité.

Profil recherché

Formation recommandée : Doctorat en épidémiologie, écologie, statistiques, physique, mathématiques appliquées ou dans une discipline quantitative apparentée.

Connaissances souhaitées : Solides connaissances en modélisation statistique spatiale et maîtrise d’au moins un langage de programmation adapté à l’analyse de données et à leur modélisation. Des connaissances en inférence bayésienne, en analyse de réseaux et en intelligence artificielle constitueraient un atout.

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Expérience appréciée : Expérience dans l’application de modèles statistiques spatiaux pour répondre à des questions de recherche en épidémiologie ou en écologie. Une expérience en matière de traitement de bases de données complexes et de développement de pipelines d’analyse reproductibles serait également appréciée.

Aptitudes recherchées : Capacité à développer et conduire des travaux de recherche avec un degré important d’autonomie, aptitude au travail en équipe et à la collaboration avec des chercheur.euse.s issu.e.s de disciplines variées ainsi qu’avec des acteur.trice.s de la surveillance et de la gestion de la santé animal, capacité à valoriser les travaux par des publications dans des revues scientifiques internationales, très bonne maîtrise de l’anglais, à l’oral comme à l’écrit.

Niveau d'études minimum requis

Niveau

Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents

Éléments de candidature

Personnes à contacter

BAILLY Xavier

FOURNIE Guillaume

Qui sommes-nous ?

INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Descriptif du service

Vous exercerez votre activité au sein de l’Unité Mixte de Recherche Épidémiologie des maladies animales et zoonotiques, reconnue pour ses travaux combinant études de terrain et modélisation dans une approche One Health. Vous travaillerez en interaction étroite avec Guillaume FOURNIE et Xavier BAILLY, qui assureront l’accompagnement scientifique de votre projet. Vous serez basé.e sur le campus de VetAgro Sup, à Marcy-l’Etoile, à proximité de Lyon.

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L’Unité souhaite renforcer durablement ses recherches en épidémiologie spatiale. A terme, elle entend structurer un programme de recherche original et ambitieux dans ce domaine, visant à développer de nouvelles méthodes pour la détection précoce des émergences, la priorisation de la surveillance et l’appui aux politiques publiques en santé animal, notamment dans leur déclinaison territoriale.

À propos de l'offre

Informations complémentaires

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

- jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein) ;

- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;

- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;

- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;

- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;

- d'activités sportives et culturelles ;

- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

Merci de transmettre votre dossier de candidature comprenant un CV, une lettre de motivation et une note de positionnement scientifique de 1500 mots maximum présentant les principaux verrous méthodologiques ciblés par le poste ainsi que la stratégie scientifique concrète et argumentée que vous proposez pour y répondre dans le cadre de cette fonction.

Rémunération : A partir de 3 559,17€ brut mensuel

Statut du poste

Susceptible d'être vacant à partir du 04/01/2027

Métier de référence

Experte / Expert en calcul scientifique